RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	LPAR1	Q92633	364 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	GJA10	Q969M2	543 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA1-208	ENST00000529524	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	MLH1	P40692	756 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	GRM3	Q14832	879 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	MEIS3	Q99687	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	IL18RAP	O95256	599 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ALAD	P13716	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	HOXB2	P14652	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ARRB2	P32121	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	STAT6	P42226	847 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF84	P51523	738 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	HYAL1	Q12794	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524		Q6ZTC4	211 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	EME1	Q96AY2	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	KIF3B	O15066	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ATG13	O75143	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	DAG1	Q14118	895 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	NFATC4	Q14934	902 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	PHKB	Q93100	1093 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	MED30	Q96HR3	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524		A6NNC1	897 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	AR	P10275	920 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	IDE	P14735	1019 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	RHCE	P18577	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	PGM5	Q15124	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	GPR78	Q96P69	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	WDR24	Q96S15	920 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA1-208	ENST00000529524	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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