RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 IRAK2O43187 625 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO21O94952 628 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 HLA-FP30511 346 aa20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 TBX4P57082 545 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM215Q68D42 235 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM124AQ86V42 546 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 CACUL1Q86Y37 369 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 UBR7Q8N806 425 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 HSFY1Q96LI6 401 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 LHX5Q9H2C1 402 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 FBRSQ9HAH7 460 aa20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 GGA2Q9UJY4 613 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 PIK3R2O00459 728 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 SH3BP5O60239 455 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TBL1XO60907 577 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 IGLV3-19P01714 112 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 LTFP02788 710 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 HLA-EP13747 358 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIK2Q13002 908 aa20.05■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 PKDCCQ504Y2 493 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MPP7Q5T2T1 576 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 PMF1Q6P1K2 205 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TFAP2BQ92481 460 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 SNX19Q92543 992 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 GNA14O95837 355 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 DNTTP04053 509 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ST8SIA6P61647 398 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB16Q05516 673 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MBLAC2Q68D91 279 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 NAXDQ8IW45 347 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MATKP42679 507 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 RING1Q06587 406 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TEAD4Q15561 434 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MFN1Q8IWA4 741 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 NELFBQ8WX92 580 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 GATA6Q92908 595 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 GAREM1Q9H706 876 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ST7Q9NRC1 585 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 CAPN9O14815 690 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 GJB3O75712 270 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ACADSBP45954 432 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM193AP78312 1265 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 GCNT1Q02742 428 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF366Q8N895 744 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 SERPINB11Q96P15 392 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 KLK13Q9UKR3 277 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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