RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492973.1

TPR-208, Transcript of translocated promoter region, nuclear basket protein, humanhuman

TSL 2

Gene TPR, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPR-208ENST00000492973 UBE4BO95155 1302 aa7.4□□□□□ -1.22
TPR-208ENST00000492973 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 INPPL1O15357 1258 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CLDN3O15551 220 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 B4GALT3O60512 393 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 OFD1O75665 1012 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CYP7B1O75881 506 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 IL18BPO95998 194 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 LINC00271P0C7V0 271 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 AKAP5P24588 427 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 HSD3B2P26439 372 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 SDHAP31040 664 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TPM4P67936 248 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 LRRC63Q05C16 580 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 NFIL3Q16649 462 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 PHF19Q5T6S3 580 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 SARM1Q6SZW1 724 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 PGBD4Q96DM1 585 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TSG101Q99816 390 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TCHPQ9BT92 498 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 THAP9Q9H5L6 903 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TMEM206Q9H813 350 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 KCND1Q9NSA2 647 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 DMAC2Q9NW81 257 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 MIOSQ9NXC5 875 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa7.39□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 COL4A6Q14031 1691 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ARL5CA6NH57 179 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 PTGESO14684 152 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CLIC2O15247 247 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 OGTO15294 1046 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 NOBOXO60393 691 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 RECQL4O94761 1208 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ADCY5O95622 1261 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 MMEP08473 750 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CLTAP09496 248 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 INHBBP09529 407 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TNFSF9P41273 254 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ZNF75DP51815 510 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 OSTNP61366 133 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 RAB30Q15771 203 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 XKR4Q5GH76 650 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 YME1L1Q96TA2 773 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 GAD1Q99259 594 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CWH43Q9H720 699 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 RSAD1Q9HA92 442 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 INSL6Q9Y581 213 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TTC3P53804 2025 aa7.38□□□□□ -1.23
TPR-208ENST00000492973 TTC26A0AVF1 554 aa7.37□□□□□ -1.23
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