RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 NFATC3Q12968 1075 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DENND1CQ8IV53 801 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RDH13Q8NBN7 331 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DDI1Q8WTU0 396 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CGRRF1Q99675 332 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DCLK3Q9C098 648 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NAGPAQ9UK23 515 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CENPEQ02224 2701 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CLSTN1O94985 981 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PDCP20941 246 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ACP1P24666 158 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ATICP31939 592 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TXLNAP40222 546 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RXRGP48443 463 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 GALCP54803 685 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 E2F1Q01094 437 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 KCNJ12Q14500 433 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PROX2Q3B8N5 592 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SV2BQ7L1I2 683 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SCD5Q86SK9 330 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 LSMEM2Q8N112 164 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF516Q92618 1163 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CLIC6Q96NY7 704 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DPH1Q9BZG8 443 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FAM117AQ9C073 453 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 HHLA1C9JL84 531 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TLR4O00206 839 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 LSSP48449 732 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NXPH1P58417 271 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 COG7P83436 770 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CUL4AQ13619 759 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PSMD6Q15008 389 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 USP30Q70CQ3 517 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 C12orf29Q8N999 325 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 GOLGA1Q92805 767 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SDCBP2Q9H190 292 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 MTG2Q9H4K7 406 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PANK4Q9NVE7 773 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 K7ENP7 123 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TRIM38O00635 465 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SIGLEC6O43699 453 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PHACTR2O75167 634 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 USP12O75317 370 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FAM200BP0CF97 657 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RALAP11233 206 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ADORA2BP29275 332 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 HLA-FP30511 346 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CYP24A1Q07973 514 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 EFEMP1Q12805 493 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF699Q32M78 642 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CHST9Q7L1S5 443 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CPXM2Q8N436 756 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SERAC1Q96JX3 654 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 LRRC72A6NJI9 287 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 HOXD13P35453 343 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 STAT6P42226 847 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 KIF11P52732 1056 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms