RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 HIPK4Q8NE63 616 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 STARD8Q92502 1023 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM20AQ96MK3 541 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 LMF1Q96S06 567 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CDC6Q99741 560 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ERP44Q9BS26 406 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 DECR2Q9NUI1 292 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 SH3D21A4FU49 640 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 K7ERQ8 282 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TBX10O75333 385 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 OPN1LWP04000 364 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 GLI1P08151 1106 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CLUP10909 449 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 KRT4P19013 534 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TYMPP19971 482 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 MAPK4P31152 587 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 GUCY1A2P33402 732 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 STARP49675 285 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TSPAN5P62079 268 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 S100A12P80511 92 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 SHHQ15465 462 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CYP4X1Q8N118 509 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 URGCPQ8TCY9 931 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 SEPT8Q92599 483 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CARD6Q9BX69 1037 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 DRC3Q9H069 523 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 VTA1Q9NP79 307 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF536O15090 1300 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 SCN7AQ01118 1682 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CCDC151A5D8V7 595 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TO15178 435 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TP73O15350 636 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 PCDHGA12O60330 932 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM63AO94886 807 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 PDGFAP04085 211 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 GSNP06396 782 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CSH1P0DML2 217 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CSH2P0DML3 217 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 LSP1P33241 339 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ETV5P41161 510 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 MAGEA4P43358 317 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CREB5Q02930 508 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 CHAF1BQ13112 559 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 DMC1Q14565 340 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF460Q14592 562 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 NFIXQ14938 502 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 HERC3Q15034 1050 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 UGP2Q16851 508 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 RGS21Q2M5E4 152 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 LIN9Q5TKA1 542 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC22A25Q6T423 547 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 GLRX5Q86SX6 157 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 KSR1Q8IVT5 923 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-208ENST00000474246 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms