RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 STARD3Q14849 445 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 BSPRYQ5W0U4 402 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CHST9Q7L1S5 443 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PDZD3Q86UT5 571 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CLEC4CQ8WTT0 213 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 DDI1Q8WTU0 396 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 KAT5Q92993 513 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 BIRC7Q96CA5 298 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 MRGPRX3Q96LB0 322 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 NUP58Q9BVL2 599 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CIPCQ9C0C6 399 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 TM9SF3Q9HD45 589 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ABCB8Q9NUT2 735 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 RAB20Q9NX57 234 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 KNTC1P50748 2209 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 TMEM131Q92545 1883 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 O00370 1275 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ZBED1O96006 694 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 IGLV3-27P01718 113 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ZNF883P0CG24 379 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 GNSP15586 552 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CHKAP35790 457 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 MATKP42679 507 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CTSKP43235 329 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 MXI1P50539 228 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 IL9RQ01113 521 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ENPEPQ07075 957 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ADIGQ0VDE8 80 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 FSCBQ5H9T9 825 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 KRT39Q6A163 491 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 DCLK3Q9C098 648 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 LHX5Q9H2C1 402 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 NPC1O15118 1278 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 OXTRP30559 389 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 SYKP43405 635 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 RGS7P49802 495 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ZNF132P52740 706 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 DAOAP59103 153 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 KCNJ12Q14500 433 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ACAP1Q15027 740 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 MBLAC2Q68D91 279 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ATL3Q6DD88 541 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PMF1Q6P1K2 205 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PLD4Q96BZ4 506 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 SLC2A11Q9BYW1 496 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 SEMA4FO95754 770 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 GTF2H1P32780 548 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 NUMBP49757 651 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 METAP1P53582 386 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CYP4F3Q08477 520 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 LRMPQ12912 555 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CUL2Q13617 745 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 MPPE1Q53F39 396 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 MSANTD2Q6P1R3 559 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms