RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	NPY6R	Q99463	290 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TRIM5	Q9C035	493 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	FAM186A	A6NE01	2351 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ANTXRL	A6NF34	631 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	F9	P00740	461 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TPM1	P09493	284 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	KRT3	P12035	628 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SGSH	P51688	502 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ATP11A	P98196	1134 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	MON1B	Q7L1V2	547 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	LGI2	Q8N0V4	545 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	USP33	Q8TEY7	942 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ACD	Q96AP0	544 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SYT11	Q9BT88	431 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	WDCP	Q9H6R7	721 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PIGV	Q9NUD9	493 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902		A0A0A0MRY4	1105 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD62	A6NC57	917 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902		F5H5T6	163 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SERPING1	P05155	500 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CISD3	P0C7P0	127 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PDGFRA	P16234	1089 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TACR2	P21452	398 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SDC4	P31431	198 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TRIM14	Q14142	442 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CDO1	Q16878	200 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TRNP1	Q6NT89	227 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	VPS36	Q86VN1	386 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ALLC	Q8N6M5	410 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SIK2	Q9H0K1	926 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RBSN	Q9H1K0	784 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		18.39	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	18.38	■□□□□ 0.53	2e-7	■■■■■ 33.6
USP19-210	ENST00000465902	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RRM1	P23921	792 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	NRL	P54845	237 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	DMC1	Q14565	340 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ARC	Q7LC44	396 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	VSTM4	Q8IW00	320 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	C3orf20	Q8ND61	904 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	NT5C3B	Q969T7	300 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	FBXO10	Q9UK96	956 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902		R4GN57	208 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		18.38	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CFAP54	Q96N23	3096 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PRRT4	C9JH25	899 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	PAGE1	O75459	146 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	WAS	P42768	502 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	CXCR3	P49682	368 aa		18.37	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53

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