RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 VPS53Q5VIR6 699 aa4.4□□□□□ -1.71
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ECHDC1-211ENST00000460558 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.4□□□□□ -1.71
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ECHDC1-211ENST00000460558 C7orf72A4D263 438 aa4.39□□□□□ -1.71
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ECHDC1-211ENST00000460558 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 28.3
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ECHDC1-211ENST00000460558 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.39□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 UBE2FQ969M7 185 aa4.39□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXW5Q969U6 566 aa4.39□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC51Q96ER9 411 aa4.39□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.39□□□□□ -1.71
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