RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 BEND5Q7L4P6 421 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 LAS2Q8IYD9 372 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 GLMPQ8WWB7 406 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 ASB12Q8WXK4 309 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 EME1Q96AY2 570 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 GPR78Q96P69 363 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 TRIM2Q9C040 744 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 A0A1W2PPC4 97 aa4.03□□□□□ -1.76
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TTC3-211ENST00000460328 M0QZQ0 153 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 ATG13O75143 517 aa4.03□□□□□ -1.76
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TTC3-211ENST00000460328 GABRB3P28472 473 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 CDC25AP30304 524 aa4.03□□□□□ -1.76
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TTC3-211ENST00000460328 LIPMQ5VYY2 423 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 C16orf89Q6UX73 402 aa4.03□□□□□ -1.76
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TTC3-211ENST00000460328 DGKHQ86XP1 1220 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC3-211ENST00000460328 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.03□□□□□ -1.76
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TTC3-211ENST00000460328 A6NNC1 897 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 APOL1O14791 398 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 VIPP01282 170 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 CHRNB1P11230 501 aa4.02□□□□□ -1.77
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TTC3-211ENST00000460328 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
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TTC3-211ENST00000460328 P2RX3P56373 397 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 ZNF585BQ52M93 769 aa4.02□□□□□ -1.77
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TTC3-211ENST00000460328 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 PMM1Q92871 262 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 ZNF479Q96JC4 524 aa4.02□□□□□ -1.77
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TTC3-211ENST00000460328 H0YGN5 161 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.01□□□□□ -1.77
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TTC3-211ENST00000460328 SLC5A1P13866 664 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 PGGT1BP53609 377 aa4.01□□□□□ -1.77
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TTC3-211ENST00000460328 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 FZD3Q9NPG1 666 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 FAM234BA2RU67 622 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 DPPA5A6NC42 116 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 NPC1O15118 1278 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 SLC28A2O43868 658 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 SGPL1O95470 568 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 WNT1P04628 370 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 NGFRP08138 427 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 PLA2G2AP14555 144 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 ARRB2P32121 409 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 CIITAP33076 1130 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 ZXDBP98169 803 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 CBFBQ13951 182 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 ISM2Q6H9L7 571 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 TXLNBQ8N3L3 684 aa4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TTC3-211ENST00000460328 FAM47BQ8NA70 645 aa4□□□□□ -1.77
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