RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
VARS-218ENST00000459667 RRN3Q9NYV6 651 aa21.52■■□□□ 1.04
VARS-218ENST00000459667 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
VARS-218ENST00000459667 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
VARS-218ENST00000459667 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.52■■□□□ 1.04
VARS-218ENST00000459667 MYO6Q9UM54 1294 aa21.52■■□□□ 1.04
VARS-218ENST00000459667 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
VARS-218ENST00000459667 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.52■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 AXIN1O15169 862 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 HRO43593 1189 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ADAM23O75077 832 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SLC2A3P11169 496 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 MMP8P22894 467 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CCR1P32246 355 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 MPP7Q5T2T1 576 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CHPFQ8IZ52 775 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 AGPAT1Q99943 283 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 EBF1Q9UH73 591 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 DMDP11532 3685 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 LRRC53A6NM62 1247 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 M0QYT0 321 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ABCB4P21439 1286 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 NTSR1P30989 418 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 WASP42768 502 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SULT1E1P49888 294 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 UBASH3AP57075 661 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CENPCQ03188 943 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ANO7Q6IWH7 933 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CHSY1Q86X52 802 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 UCMAQ8WVF2 138 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ACOX2Q99424 681 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 NPY6RQ99463 290 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 STIM2Q9P246 746 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 RAB23Q9ULC3 237 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 EML5Q05BV3 1969 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ALDH1A2O94788 518 aa21.49■■□□□ 1.03
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VARS-218ENST00000459667 TACR2P21452 398 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 HLA-FP30511 346 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 FLT3P36888 993 aa21.49■■□□□ 1.03
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VARS-218ENST00000459667 CEP68Q76N32 757 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 RASSF3Q86WH2 238 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 LGI2Q8N0V4 545 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 GAB3Q8WWW8 586 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TPM3P06753 285 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 RPS24P62847 133 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 LPAL2Q16609 132 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 MFN1Q8IWA4 741 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 NT5C3BQ969T7 300 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TBCBQ99426 244 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CIPCQ9C0C6 399 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 PIGVQ9NUD9 493 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 GGA2Q9UJY4 613 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 F5H5T6 163 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 DEUP1Q05D60 604 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 PTP4A2Q12974 167 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 MTA1Q13330 715 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 ASIC2Q16515 512 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-218ENST00000459667 TMEM215Q68D42 235 aa21.47■■□□□ 1.03
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