RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457356.8

MSC-AS1-201, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSC-AS1, Length 4,220 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-201ENST00000457356 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 CACNA1FO60840 1977 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 TM9SF1O15321 606 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 HSMCR30P0CW71 290 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SYN1P17600 705 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 GPD1P21695 349 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 KYAT1Q16773 422 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 Q4G0T1 1027 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 TBCELQ5QJ74 424 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 YAF2Q8IY57 180 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR8H2Q8N162 312 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF570Q96NI8 536 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 DCDC2Q9UHG0 476 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 RNF103O00237 685 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 INPP4BO15327 924 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 NDUFS3O75489 264 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 GJB6O95452 261 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 ATP6V1C1P21283 382 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 MCL1Q07820 350 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF235Q14590 738 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 EML3Q32P44 896 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 TTC30AQ86WT1 665 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 EFHBQ8N7U6 833 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC35C1Q96A29 364 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 AGRPO00253 132 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 GJB1P08034 283 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 FGFR3P22607 806 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 PSMB9P28065 219 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 AP3M2P53677 418 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 KRT72Q14CN4 511 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 CD302Q8IX05 232 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 ABRAQ8N0Z2 381 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 CEP41Q9BYV8 373 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 DCLK3Q9C098 648 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SAR1AQ9NR31 198 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 IMPAD1Q9NX62 359 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 RRN3Q9NYV6 651 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 USE1Q9NZ43 259 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 CNTNAP1P78357 1384 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM86B1E9PN63 330 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 GRK2P25098 689 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 NCALDP61601 193 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 CUL2Q13617 745 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 PDK1Q15118 436 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 CEP78Q5JTW2 689 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 CST9Q5W186 159 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 SNX32Q86XE0 403 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 EXD1Q8NHP7 514 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 UBP1Q9NZI7 540 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 GGA2Q9UJY4 613 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 COL18A1P39060 1754 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 NRCAMQ92823 1304 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF197O14709 1029 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms