RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 CKMP06732 381 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SERPINF2P08697 491 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 TUBP50607 506 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 POU6F1Q14863 301 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 PARP6Q2NL67 630 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ADAM2Q99965 735 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 LHX5Q9H2C1 402 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 PTPN4P29074 926 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 CYP2C18P33260 490 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 AVPR1AP37288 418 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 GRTP1Q5TC63 336 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.48■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 A0A0A0MRY4 1105 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 WDR27A2RRH5 827 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 BDNFP23560 247 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 NUDT2P50583 147 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 FKBP1BP68106 108 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SZRD1Q7Z422 152 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 C12orf42Q96LP6 360 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SPATA13Q96N96 652 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM237Q96Q45 408 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 GPAMQ9HCL2 828 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 DGKIO75912 1065 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SERPINE1P05121 402 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 RHOCP08134 193 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 USP17L7P0C7H9 530 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 TSHRP16473 764 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ARL2P36404 184 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 CD151P48509 253 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SYTL3Q4VX76 610 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 PPTC7Q8NI37 304 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF670Q9BS34 389 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 RNF19AQ9NV58 838 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ETS1P14921 441 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 VHLP40337 213 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 KCNK10P57789 538 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 RUBCNLQ9H714 662 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 MPOP05164 745 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 URODP06132 367 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 YWHAQP27348 245 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 NAB1Q13506 487 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 KCNMB4Q86W47 210 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 NUP93Q8N1F7 819 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 WNK4Q96J92 1243 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 THAP1Q9NVV9 213 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.47■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 AKAP10O43572 662 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ASMTLO95671 621 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ADRA1DP25100 572 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SCNN1GP51170 649 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 GTF2H3Q13889 308 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 FLOT2Q14254 428 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC153Q494R4 210 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 BHMTQ93088 406 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 COL1A2P08123 1366 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 SYCE1LA8MT33 242 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM13O60858 407 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 GLP2RO95838 553 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 TPH1P17752 444 aa16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
C9orf172-201ENST00000436881 ITGA9Q13797 1035 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.3 ms