RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 MEI4A8MW99 385 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP33O14559 1287 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 CAPN9O14815 690 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 ACSL4O60488 711 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 OPHN1O60890 802 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 IGLV3-27P01718 113 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 HLA-FP30511 346 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 UBE2HP62256 183 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 NNTQ13423 1086 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 OR2T3Q8NH03 318 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 STK32AQ8WU08 396 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 NUP58Q9BVL2 599 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 GPR174Q9BXC1 333 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 FBRSQ9HAH7 460 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 GGA2Q9UJY4 613 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-206ENST00000431413 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.77■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 LAMA1P25391 3075 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 GIPC1O14908 333 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 TBL1XO60907 577 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 GABBR2O75899 941 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 PRKCHP24723 683 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 GPD2P43304 727 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 TPMTP51580 245 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 TMEM215Q68D42 235 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 BEND5Q7L4P6 421 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 DEFB124Q8NES8 71 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 MED15Q96RN5 788 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 THAP12O43422 761 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 GNA15P30679 374 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 RPL34P49207 117 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 COPAP53621 1224 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 CAMK4Q16566 473 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 ST3GAL2Q16842 350 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 MBLAC2Q68D91 279 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 GBP6Q6ZN66 633 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 MFN1Q8IWA4 741 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 ZNF606Q8WXB4 792 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 PCED1AQ9H1Q7 454 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 CD93Q9NPY3 652 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 SUN2Q9UH99 717 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GTW7 788 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 CALCAP01258 141 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 IGLV3-19P01714 112 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 APOEP02649 317 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 HLA-EP13747 358 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 USP8P40818 1118 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 ST8SIA6P61647 398 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB16Q05516 673 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 FOXC1Q12948 553 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 SEMA3BQ13214 749 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 SLC14A1Q13336 389 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 ADIPOR2Q86V24 386 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 MLKLQ8NB16 471 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 LHX5Q9H2C1 402 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 TMEM245Q9H330 911 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 POPDC2Q9HBU9 364 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 STIM2Q9P246 746 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HERC3-206ENST00000431413 PI4KAP42356 2102 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms