RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 GMIPQ9P107 970 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 MTMR6Q9Y217 621 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 ZZEF1O43149 2961 aa6.93□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.93□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 WISP1O95388 367 aa6.93□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 FUKQ8N0W3 1084 aa6.93□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.93□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.93□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 WASH3PC4AMC7 463 aa6.92□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.92□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 EHD2Q9NZN4 543 aa6.92□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.91□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.91□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 HHLA1C9JL84 531 aa6.91□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 MDM4O15151 490 aa6.91□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SH3BP5O60239 455 aa6.91□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINF2P08697 491 aa6.91□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CISD3P0C7P0 127 aa6.91□□□□□ -1.3
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