RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 BNIP3Q12983 259 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 MPPE1Q53F39 396 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 ARID3AQ99856 593 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 FBRSQ9HAH7 460 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 STX6O43752 255 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 GLDCP23378 1020 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 ASPAP45381 313 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 GALCP54803 685 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 KCNH2Q12809 1159 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 UBE4BO95155 1302 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PR77 199 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 E2F4Q16254 413 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 GANCQ8TET4 914 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SKA1Q96BD8 255 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP16Q9BY84 665 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 MYO18BQ8IUG5 2567 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CD38P28907 300 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CASP1P29466 404 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 EHHADHQ08426 723 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PDE4CQ08493 712 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 KCNJ12Q14500 433 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ZACNQ401N2 412 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 MBLAC2Q68D91 279 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TAF4BQ92750 862 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA1Q92805 767 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 USP28Q96RU2 1077 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 LGMNQ99538 433 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CLMPQ9H6B4 373 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 GDF3Q9NR23 364 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SUN2Q9UH99 717 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 GGA2Q9UJY4 613 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CKMT2P17540 419 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 INCA1Q0VD86 236 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ILKQ13418 452 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SLC39A14Q15043 492 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 USP30Q70CQ3 517 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SV2AQ7L0J3 742 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 AHI1Q8N157 1196 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 PLD4Q96BZ4 506 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PP55 124 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 YKT6O15498 198 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP6O43182 974 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SGSHP51688 502 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 AMPD3Q01432 767 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RHDQ02161 417 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 LY6DQ14210 128 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 UNC13DQ70J99 1090 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD12-201ENST00000404162 RFFLQ8WZ73 363 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms