RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 BIN1O00499 593 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 FLRT2O43155 660 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 STX10O60499 249 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CBFA2T3O75081 653 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ZBED1O96006 694 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 MXI1P50539 228 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 COPAP53621 1224 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ZNF445P59923 1031 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 PAK1Q13153 545 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TEAD4Q15561 434 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CAMK4Q16566 473 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 HLA-BQ31612 363 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CBWD6Q4V339 395 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 MPPE1Q53F39 396 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 RAB41Q5JT25 222 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CBWD3Q5JTY5 395 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CBWD5Q5RIA9 395 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 PIGZQ86VD9 579 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 FAM217AQ8IXS0 508 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 OR2T3Q8NH03 318 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 NELFBQ8WX92 580 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 SEMA4DQ92854 862 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TMEM176AQ96HP8 235 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 LHX5Q9H2C1 402 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 PLA2G4CQ9UP65 541 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 GPSM3Q9Y4H4 160 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 NBEAQ8NFP9 2946 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CKAP5Q14008 2032 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TAF4O00268 1085 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CAPNS1P04632 268 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TKTL1P51854 596 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 RAD23BP54727 409 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ARHGAP17Q68EM7 881 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD52Q8NB46 1076 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 SLC4A11Q8NBS3 891 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 FBXL13Q8NEE6 735 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 RNF139Q8WU17 664 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 GBP4Q96PP9 640 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ARID3AQ99856 593 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 FBRSQ9HAH7 460 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 RAB20Q9NX57 234 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 RWDD2AQ9UIY3 292 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CLEC4EQ9ULY5 219 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CTNND2Q9UQB3 1225 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ACACAQ13085 2346 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GVT2 93 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 BCAT1P54687 386 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 PDE4CQ08493 712 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TMEM215Q68D42 235 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 PM20D1Q6GTS8 502 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 SLCO6A1Q86UG4 719 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 FMNL3Q8IVF7 1028 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TRIM59Q8IWR1 403 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 MLKLQ8NB16 471 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 GPT2Q8TD30 523 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ULBP1Q9BZM6 244 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 LRRC4Q9HBW1 653 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 HESX1Q9UBX0 185 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 APC2O95996 2303 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TSPAN3O60637 253 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 SEMA4FO95754 770 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 LATS1O95835 1130 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 GNA14O95837 355 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 DNTTP04053 509 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 HLA-EP13747 358 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 HLA-FP30511 346 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 GRIA4P48058 902 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 FMO5P49326 533 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 BNC1Q01954 994 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ZBTB16Q05516 673 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 BST2Q10589 180 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 INAVAQ3KP66 663 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ADGRF1Q5T601 910 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 KLHL10Q6JEL2 608 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 C19orf48Q6RUI8 117 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 IRF2BP1Q8IU81 584 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 AHI1Q8N157 1196 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 GALNT15Q8N3T1 639 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 UBR7Q8N806 425 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 C1orf216Q8TAB5 229 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 LMO3Q8TAP4 145 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms