RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC37A1P57057 533 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP10-2P60368 255 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDK18Q07002 472 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC15Q0P6D6 951 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TUBA3CQ13748 450 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 BMPR2Q13873 1038 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPRRQ15256 657 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ST3GAL2Q16842 350 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NBPF8Q3BBV2 869 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCID2Q5JVF3 399 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SH2D4BQ5SQS7 431 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KAZNQ674X7 775 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIAA0895LQ68EN5 471 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACAD10Q6JQN1 1059 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TUBA3EQ6PEY2 450 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF627Q7L945 461 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NME8Q8N427 588 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIRT6Q8N6T7 355 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CXorf38Q8TB03 319 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC2A12Q8TD20 617 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACTRT2Q8TDY3 377 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RUFY2Q8WXA3 655 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 HAS1Q92839 578 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 LENG9Q96B70 501 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELP4Q96EB1 424 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNFT2Q96EX2 444 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF503Q96F45 646 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 KAZALD1Q96I82 304 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 VPS50Q96JG6 964 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PGBD1Q96JS3 809 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLSTN3Q9BQT9 956 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 FSD1LQ9BXM9 530 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 CIPCQ9C0C6 399 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDE11AQ9HCR9 933 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 RASSF1Q9NS23 344 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRAK4Q9NWZ3 460 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTMR4Q9NYA4 1195 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMFRQ9UKV5 643 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB8E9PQR5 432 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNAP23O00161 211 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPPED1O15442 326 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 GFPT2O94808 682 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 INSRRP14616 1297 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD19P15391 556 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NDUFB7P17568 137 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRPH2P23942 346 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NDUFS1P28331 727 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPN9P43378 593 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 VPS41P49754 854 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 DGKQP52824 942 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC14A1Q13336 389 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXE3Q13461 319 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 EFR3AQ14156 821 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MFSD13AQ14CX5 517 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD1Q15327 319 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NFIL3Q16649 462 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 AP5B1Q2VPB7 878 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO43Q4G163 708 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTXN3Q4LDR2 81 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM69AQ5T7M9 428 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 HAUS3Q68CZ6 603 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAAH2Q6GMR7 532 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6ZPA2 131 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMIGO2Q86SJ2 522 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 LCORLQ8N3X6 602 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC9BQ8N6N2 239 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD44Q8N8A2 993 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PNPLA1Q8N8W4 532 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FSIP1Q8NA03 581 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR52L2PQ8NGH6 319 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 C2CD4CQ8TF44 421 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SDCCAG3Q96C92 435 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAR2Q96K12 515 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NEUROD6Q96NK8 337 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIGSQ96S52 555 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALG8Q9BVK2 526 aa2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms