RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 PAGE1O75459 146 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 TBX18O95935 607 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 C1RP00736 705 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 POLBP06746 335 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SERPINA4P29622 427 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 JAMLQ86YT9 394 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 TFAP2BQ92481 460 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 TTC17Q96AE7 1141 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF333Q96JL9 665 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SAMD11Q96NU1 681 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 MID2Q9UJV3 735 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 PTPRJQ12913 1337 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 RASA4BC9J798 803 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 RASA4O43374 803 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ESRRBO95718 433 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 GFAPP14136 432 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ITGALP20701 1170 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 FLT3P36888 993 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 C2orf27AQ580R0 203 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 DOK6Q6PKX4 331 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 GKN1Q9NS71 199 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ASB3Q9Y575 518 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 E2F8A0AVK6 867 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 HCRTO43612 131 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 GJB5O95377 273 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 CHEK2O96017 543 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 EPHX1P07099 455 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 MMP13P45452 471 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 POU6F1Q14863 301 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SZRD1Q7Z422 152 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF516Q92618 1163 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 EPC1Q9H2F5 836 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 C9IYK1 514 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 AP5Z1O43299 807 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ERBB2P04626 1255 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 TPH1P17752 444 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ERCC2P18074 760 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 TGM2P21980 687 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 PRKCIP41743 596 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SEC13P55735 322 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 IL9RQ01113 521 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 CENPCQ03188 943 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ACAP1Q15027 740 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 UGP2Q16851 508 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 CALML6Q8TD86 181 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 DNTTP04053 509 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 GOT1P17174 413 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 FDFT1P37268 417 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 RGS4P49798 205 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 PMS2P54278 862 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 MPPE1Q53F39 396 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 EMBQ6PCB8 327 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms