RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 MROH9Q5TGP6 573 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 CATSPER1Q8NEC5 780 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 HAUS8Q9BT25 410 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PDLIM7Q9NR12 457 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PTPRJQ12913 1337 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 DCXO43602 365 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PSMD6Q15008 389 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ADCY4Q8NFM4 1077 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 HSPH1Q92598 858 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PNPOQ9NVS9 261 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 GGA3Q9NZ52 723 aa17.29■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 MAFGO15525 162 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 COX4I1P13073 169 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 NELFEP18615 380 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 SLC1A6P48664 564 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 MBLAC2Q68D91 279 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 TMEM53Q6P2H8 277 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 DNAJC24Q6P3W2 148 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ADGRF2Q8IZF7 708 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 VPS50Q96JG6 964 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 SLC2A11Q9BYW1 496 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 HEY1Q9Y5J3 304 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PCNTO95613 3336 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 FAM189A1O60320 539 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 CSH1P0DML2 217 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 CSH2P0DML3 217 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PSMC3P17980 439 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ACO1P21399 889 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 CRHR1P34998 444 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 WDR44Q5JSH3 913 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 SCARA3Q6AZY7 606 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 C16orf46Q6P387 395 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 USP37Q86T82 979 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 NLRP7Q8WX94 980 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 HAPLN2Q9GZV7 340 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 SELENONQ9NZV5 590 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 STK39Q9UEW8 545 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 EFR3BQ9Y2G0 817 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 HTR3EA5X5Y0 456 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 FBP2O00757 339 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 KCNA4P22459 653 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 MMP8P22894 467 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PHKA2P46019 1235 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 FLOT2Q14254 428 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ATG14Q6ZNE5 492 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 BBS12Q6ZW61 710 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 EEPD1Q7L9B9 569 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 KRT38O76015 456 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 HLA-DRAP01903 254 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 GARTP22102 1010 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 HSPA13P48723 471 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 TGFBIQ15582 683 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 XKR3Q5GH77 459 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 LZTR1Q8N653 840 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 PKP2Q99959 881 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.27■□□□□ 0.36
GDE1-201ENST00000353258 HMX2A2RU54 273 aa17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 GSRP00390 522 aa17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ALDH3B2P48448 385 aa17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KLRG1Q96E93 195 aa17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PLAC1Q9HBJ0 212 aa17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RNF11Q9Y3C5 154 aa17.27■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ALDH2P05091 517 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 EDN1P05305 212 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 THOP1P52888 689 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NUP107P57740 925 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KCNJ11Q14654 390 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 COX4I2Q96KJ9 171 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RANBP9Q96S59 729 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa17.26■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KLC2Q9H0B6 622 aa17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms