RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 KRT10P13645 584 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 HOXA9P31269 272 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 ELF1P32519 619 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 USP46P62068 366 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 TFDP2Q14188 446 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 DPYSL3Q14195 570 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 BBS12Q6ZW61 710 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 RNF139Q8WU17 664 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 PIGVQ9NUD9 493 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 AMACRQ9UHK6 382 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 FZD10Q9ULW2 581 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 NOTCH4Q99466 2003 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 A0A1W2PQH9 124 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 SOAT2O75908 522 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 IGLV3-25P01717 112 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 C8AP07357 584 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 ATF6P18850 670 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 COILP38432 576 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 ALDH1A3P47895 512 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 SCAPQ12770 1279 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 TCF15Q12870 199 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC185Q8N715 623 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 PNKPQ96T60 521 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 DCLK3Q9C098 648 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 FAM187AA6NFU0 413 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 POU2F2P09086 479 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CD48P09326 243 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CSH1P0DML2 217 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CSH2P0DML3 217 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CXCR3P49682 368 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 PTPN5P54829 565 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 DR1Q01658 176 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 BRD3Q15059 726 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 EFHC2Q5JST6 749 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 GRK7Q8WTQ7 553 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 NMUR1Q9HB89 426 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 COX16Q9P0S2 106 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC151A5D8V7 595 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 CST8O60676 142 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 L1CAMP32004 1257 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 ADRA1BP35368 520 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 NUBP1P53384 320 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 TAF10Q12962 218 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 VEPH1Q14D04 833 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 RTL10Q7L3V2 364 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 TAC4Q86UU9 113 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 RFX6Q8HWS3 928 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 IFT20Q8IY31 132 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 ADAM32Q8TC27 787 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 GPR152Q8TDT2 470 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 SLCO2A1Q92959 643 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 NXPE3Q969Y0 559 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 FAF2Q96CS3 445 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 SERPINB11Q96P15 392 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 RNF157Q96PX1 679 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 RAB17Q9H0T7 212 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 WDCPQ9H6R7 721 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 GMIPQ9P107 970 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 IRAK2O43187 625 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 ERLIN1O75477 346 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 SEC24AO95486 1093 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 LAMP2P13473 410 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 ARL4AP40617 200 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 SLC7A5Q01650 507 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 LMNB2Q03252 620 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 ADCY2Q08462 1091 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 CA9Q16790 459 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms