RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326828.5

CHRNA3-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 3 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA3, Length 3,202 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3-201ENST00000326828 ASPAP45381 313 aa14.7□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 SNX31Q8N9S9 440 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.7□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.7□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.69□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 Q9H521 79 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.69□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 PRAMEP78395 509 aa14.69□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.69□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.69□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 FAM151AQ8WW52 585 aa14.69□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 CDH15P55291 814 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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CHRNA3-201ENST00000326828 BIRC5O15392 142 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 MPSTP25325 297 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 STT3AP46977 705 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 IRF9Q00978 393 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 CCNYQ8ND76 341 aa14.68□□□□□ -0.06
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