RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316881.8

TRIM25-201, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM25, Length 5,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-201ENST00000316881 UBP1Q9NZI7 540 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PGK1P00558 417 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 LTFP02788 710 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CD151P48509 253 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 NR2C2P49116 596 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SCNN1GP51170 649 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 COPAP53621 1224 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 XRCC4Q13426 336 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 USP45Q70EL2 814 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 GPR142Q7Z601 462 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 DEFB106AQ8N104 65 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 REPS1Q96D71 796 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CCL23P55773 120 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SLC9A5Q14940 896 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM245Q9H330 911 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 A0A087X0B3 334 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 HECTD3Q5T447 861 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 V9GYQ6 96 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SLC6A3Q01959 620 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 FUT11Q495W5 492 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 NSL1Q96IY1 281 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SYBUQ9NX95 663 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 O00370 1275 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CYP3A4P08684 503 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 NPY2RP49146 381 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 APBB2Q92870 758 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 POLG2Q9UHN1 485 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 THRAP10827 490 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MLH1P40692 756 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 POU6F1Q14863 301 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 UNC93AQ86WB7 457 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ALBP02768 609 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 HMGCRP04035 888 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CSH1P0DML2 217 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CSH2P0DML3 217 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.072e-7■■□□□ 13
TRIM25-201ENST00000316881 CHKAP35790 457 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PWP1Q13610 501 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DOK6Q6PKX4 331 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CACUL1Q86Y37 369 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ACOX2Q99424 681 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PORCNQ9H237 461 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ERFP50548 548 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 USP41Q3LFD5 358 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CDK20Q8IZL9 346 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 VAT1Q99536 393 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 USE1Q9NZ43 259 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PSEN1P49768 467 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 NUDT2P50583 147 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PLIN5Q00G26 463 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CHRNB3Q05901 458 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ACTL9Q8TC94 416 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms