RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 DCTN3O75935 186 aa24.7■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 ALDH3A1P30838 453 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 ADRA1BP35368 520 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 CACNA2D1P54289 1103 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 SCAPQ12770 1279 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 CCNYQ8ND76 341 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 ADAM32Q8TC27 787 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 TRIB2Q92519 343 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.7■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 PCNTO95613 3336 aa24.69■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 KRT38O76015 456 aa24.69■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 USP17L7P0C7H9 530 aa24.69■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 MTBPQ96DY7 904 aa24.69■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.69■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.69■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 UGT1A9O60656 530 aa24.69■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 UGT1A7Q9HAW7 530 aa24.69■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 UGT1A10Q9HAW8 530 aa24.69■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 UGT1A8Q9HAW9 530 aa24.69■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 CHKBQ9Y259 395 aa24.69■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 HHLA1C9JL84 531 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 MGRN1O60291 552 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 NCAM1P13591 858 aa24.68■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 CCNFP41002 786 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 RAB27AP51159 221 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 SEMA3BQ13214 749 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 STEAP4Q687X5 459 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC8BQ6P9F7 803 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 TTC17Q96AE7 1141 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL29Q96CT2 875 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 ERP27Q96DN0 273 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 FAM72CH0Y354 149 aa24.68■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 SREBF2Q12772 1141 aa24.68■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 FAM72BQ86X60 149 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF398Q8TD17 642 aa24.68■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.68■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 WDR27A2RRH5 827 aa24.67■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 THPOP40225 353 aa24.67■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 KCNJ2P63252 427 aa24.67■■□□□ 1.54
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TRIM54-201ENST00000296098 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 CYS1Q717R9 158 aa24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 TSSK1BQ9BXA7 367 aa24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 I3L4J1 428 aa24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 SEPT4O43236 478 aa24.66■■□□□ 1.54
TRIM54-201ENST00000296098 RFPL1O75677 317 aa24.66■■□□□ 1.54
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