RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK18Q7Z418 384 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ATG16L2Q8NAA4 619 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 UCMAQ8WVF2 138 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RHBDL2Q9NX52 303 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 VAC14Q08AM6 782 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MREGQ8N565 214 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 STMN3Q9NZ72 180 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 EML1O00423 815 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 AMPD1P23109 780 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 NCF4Q15080 339 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PHF21BQ96EK2 531 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 IDI2Q9BXS1 227 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CAPZA2P47755 286 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 DPYSL3Q14195 570 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 REPS2Q8NFH8 660 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ASB2Q96Q27 587 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 DPY30Q9C005 99 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RAMP2O60895 175 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TNFAIP8O95379 198 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ADRA1DP25100 572 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A1P53985 500 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ERAP2Q6P179 960 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 HPS4Q9NQG7 708 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SCNN1BP51168 640 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC38Q5VT99 294 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ANKS6Q68DC2 871 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MTERF3Q96E29 417 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MRASO14807 208 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 VPS4BO75351 444 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CEP78Q5JTW2 689 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM237Q96Q45 408 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 COPG2Q9UBF2 871 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ITSN1Q15811 1721 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TCF3P15923 654 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 HALP42357 657 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PPATQ06203 517 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PWP1Q13610 501 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 FUKQ8N0W3 1084 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 AGLP35573 1532 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CBX4O00257 560 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TPH1P17752 444 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RAB27AP51159 221 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MAGED4Q96JG8 741 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ACOX2Q99424 681 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 WDR41Q9HAD4 459 aa21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RETSATQ6NUM9 610 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 LPCAT2Q7L5N7 544 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A23Q9BV35 468 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RGS18Q9NS28 235 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRB1O14514 1584 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH1A2O94788 518 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms