RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 SOWAHAQ2M3V2 549 aa28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 TAPT1Q6NXT6 567 aa28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 PACS1Q6VY07 963 aa28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 FERMT1Q9BQL6 677 aa28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
UBP1-201ENST00000283628 OPHN1O60890 802 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 NPTXRO95502 500 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 LINGO3P0C6S8 592 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 VAV1P15498 845 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PGAM1P18669 254 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 KDSRQ06136 332 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 CASC4Q6P4E1 433 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 FAM96AQ9H5X1 160 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 VTA1Q9NP79 307 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 DNAJB4Q9UDY4 337 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K7O43318 606 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF286BP0CG31 522 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 AMPD1P23109 780 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ULK2Q8IYT8 1036 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 CRYBG2Q8N1P7 616 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 C7orf31Q8N865 590 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 DTX3LQ8TDB6 740 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 DNAI2Q9GZS0 605 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa28.82■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 GOT1P17174 413 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 FBXO27Q8NI29 283 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 HSFY1Q96LI6 401 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 DPEP3Q9H4B8 488 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 SNTG2Q9NY99 539 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 EMCNQ9ULC0 261 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PDHXO00330 501 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 LCP1P13796 627 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 CCNA1P78396 465 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 INSCQ1MX18 579 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 EFHC1Q5JVL4 640 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 SLC27A1Q6PCB7 646 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 VCXQ9H320 206 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 FZD10Q9ULW2 581 aa28.81■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.22e-6■■■■■ 47.4
UBP1-201ENST00000283628 DPPA5A6NC42 116 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 H3BRB1 525 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 TPP1O14773 563 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PLIN3O60664 434 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ACTR3P61158 418 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP8P85298 464 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF792Q3KQV3 632 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MDH1BQ5I0G3 518 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MAGEB5Q9BZ81 275 aa28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 BTBD19C9JJ37 291 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 CCDC130P13994 396 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 GRK2P25098 689 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ADORA2BP29275 332 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 SLC1A6P48664 564 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 GLUD2P49448 558 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 GTF2A2P52657 109 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 GRIK4Q16099 956 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 C9orf57Q5W0N0 161 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 CCDC33Q8N5R6 958 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 EBF4Q9BQW3 602 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 CXCL16Q9H2A7 254 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 GPAMQ9HCL2 828 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PLXNB2O15031 1838 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 KLHL2O95198 593 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 SERPINE1P05121 402 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ADORA2AP29274 412 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MATKP42679 507 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 UNC5BQ8IZJ1 945 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ARNTL2Q8WYA1 636 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 THTPAQ9BU02 230 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 SOX13Q9UN79 622 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa28.79■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 RNF103O00237 685 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MXRA7P84157 204 aa28.78■■■□□ 2.2
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