RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281187.9

VPS26B-201, Transcript of VPS26, retromer complex component B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPS26B, Length 3,691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26B-201ENST00000281187 MYLK3Q32MK0 819 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TMEM198Q66K66 360 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ARCQ7LC44 396 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 RNF169Q8NCN4 708 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CNDP1Q96KN2 507 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ING2Q9H160 280 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 UBP1Q9NZI7 540 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 A0A096LPK6 155 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 KCNK1O00180 336 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PRKCBP05771 671 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ADORA2BP29275 332 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 THOP1P52888 689 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 NME3Q13232 169 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 NUP93Q8N1F7 819 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PIGNO95427 931 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MMP10P09238 476 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 OCM2P0CE71 109 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 NPR1P16066 1061 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 NOVP48745 357 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CNPY3Q9BT09 278 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SELENONQ9NZV5 590 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.6□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PIK3R1P27986 724 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CRHR1P34998 444 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 GRIA2P42262 883 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 DSELQ8IZU8 1212 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 FAM47BQ8NA70 645 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 DCCP43146 1447 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 A0A0J9YVX5 310 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 KDM1AO60341 852 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TPH1P17752 444 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CYP2F1P24903 491 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MPSTP25325 297 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 GABRB2P47870 512 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 IL1RL1Q01638 556 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 RALGDSQ12967 914 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SLC12A1Q13621 1099 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 AZIN2Q96A70 460 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 USP54Q70EL1 1684 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PHKA2P46019 1235 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 HSPA13P48723 471 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 AMHR2Q16671 573 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MTX3Q5HYI7 312 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 FAM131BQ86XD5 332 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PAF1Q8N7H5 531 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ATG4CQ96DT6 458 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 RNF157Q96PX1 679 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 TRIM13O60858 407 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 RFPL1O75677 317 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 GBE1Q04446 702 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 AGKQ53H12 422 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 LZICQ8WZA0 190 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 BTBD9Q96Q07 612 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VPS26B-201ENST00000281187 DRC3Q9H069 523 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms