RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 UBDO15205 165 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 APOL5Q9BWW9 433 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.24□□□□□ -0.93
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