RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PGLYRP2Q96PD5 576 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SMC6Q96SB8 1091 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SDCBP2Q9H190 292 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PHTF1Q9UMS5 762 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC34A2O95436 690 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ASS1P00966 412 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 WEE2P0C1S8 567 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNQ1P51787 676 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 RCOR2Q8IZ40 523 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRF2Q8IZF7 708 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C4K7 107 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR44Q5JSH3 913 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 WASHC2DQ5SRD0 308 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD54Q6NXT1 300 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTA5Q7RTV2 222 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LPIN3Q9BQK8 851 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 HERPUD2Q9BSE4 406 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 MYLK2Q9H1R3 596 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 EDF1O60869 148 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LMNAP02545 664 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ATICP31939 592 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 MORF4L2Q15014 288 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TOP6BLQ8N6T0 577 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 KREMEN2Q8NCW0 462 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf72Q96LT7 481 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CRISPLD1Q9H336 500 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TRABDQ9H4I3 376 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 VRTNQ9H8Y1 702 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC24AO95486 1093 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 STAU1O95793 577 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CALB2P22676 271 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PAX3P23760 479 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CALRP27797 417 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 P3H1Q32P28 736 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC8CQ8TDW0 803 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TMLHEQ9NVH6 421 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRDO14764 452 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ABLIM3O94929 683 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PDGFRBP09619 1106 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CPB1P15086 417 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CREMQ03060 361 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF667Q5HYK9 610 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC38Q5VT99 294 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa27.22■■□□□ 1.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 TTC9BQ8N6N2 239 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF461Q8TAF7 563 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBB6Q9BUF5 446 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SAR1AQ9NR31 198 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 THEGQ9P2T0 379 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 DSEQ9UL01 958 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC42Q9Y546 428 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TJP3O95049 919 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN7P35236 360 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 NOP14P78316 857 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SMYD5Q6GMV2 418 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CASP10Q92851 521 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ERP27Q96DN0 273 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 S1PR5Q9H228 398 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SAYSD1Q9NPB0 183 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXW11Q9UKB1 542 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MUI8 341 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LIASO43766 372 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPAP45381 313 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS41P49754 854 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCY1Q08828 1119 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC45A4Q5BKX6 768 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ATAD1Q8NBU5 361 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 IP6K2Q9UHH9 426 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SHOC2Q9UQ13 582 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ZWINTO95229 277 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 GNAZP19086 355 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PAX7P23759 505 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ORC1Q13415 861 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CPA5Q8WXQ8 436 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 HEMGNQ9BXL5 484 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 DPEP3Q9H4B8 488 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CHKBQ9Y259 395 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 GRXCR2A6NFK2 248 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CLGNO14967 610 aa27.2■■□□□ 1.94
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