RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif11Q6P9P6 1052 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rd3Q8BRE0 195 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb1Q91Y08 818 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GhdcQ99J23 532 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oxct1Q9D0K2 520 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr3cQ9D483 533 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chmp2aQ9DB34 222 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pck1Q9Z2V4 622 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xbp1O35426 267 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Drg1P32233 367 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc127Q3TC33 260 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubn1Q4G0F8 1135 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PighQ5M9N4 188 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmgb4Q6P8W9 181 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec1aQ8BWY2 269 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acbd6Q9D061 282 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Satl1Q9D5N8 744 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajb4Q9D832 337 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccr10Q9JL21 362 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp2Q9Z0E6 589 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akap17bA2A3V1 959 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp715G3X9T1 886 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il3P01586 166 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elk3P41971 409 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PfkmP47857 780 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gp1bbP56400 206 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl4cP61208 192 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ampd1Q3V1D3 745 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cntn2Q61330 1040 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FsbpQ8BKE5 299 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr35Q8BND3 1181 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmtf1Q8CE22 761 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam151aQ8QZW3 608 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rabep2Q91WG2 554 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trps1Q925H1 1281 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xpo7Q9EPK7 1087 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc13a1Q9JHI4 594 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc22Q9JIG7 627 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpc2Q9R244 1172 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700001O22RikA2APZ1 375 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1023A2ASU6 311 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Siah3B2RWG3 268 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D3Z070 196 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdh9F8VPK8 1237 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AlbP07724 608 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 M6prP24668 278 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FpgsP48760 587 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd8Q50H33 476 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RetsatQ64FW2 609 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stx18Q8VDS8 334 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha11Q91Y19 950 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Twf1Q91YR1 350 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nek8Q91ZR4 698 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdelr1Q99JH8 212 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bace2Q9JL18 514 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts9E9PUN6 1931 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Per2O54943 1257 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KitP05532 979 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnat1P20612 350 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nos2P29477 1144 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NrlP54846 237 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 YwhagP61982 247 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nipal4Q8BZF2 406 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5591Q8CDK1 855 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trip10Q8CJ53 603 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abhd8Q8R0P8 439 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha3Q91Y16 942 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrp8Q924X6 996 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nme5Q99MH5 211 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcaf6Q9DC22 876 aa13.03□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfr2E9Q5M4 874 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DldO08749 509 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Axin1O35625 863 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gja8P28236 440 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P3h1Q3V1T4 739 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crhr2Q60748 411 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndrg1Q62433 394 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nuak1Q641K5 658 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyth4Q80YW0 393 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp4aQ8BU40 982 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GancQ8BVW0 898 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ace2Q8R0I0 805 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tasp1Q8R1G1 420 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx36Q8VHK9 1001 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AslQ91YI0 464 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpt1bQ924X2 772 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pard3bQ9CSB4 1203 aa13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms