RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tph2Q8CGV2 488 aa23.54■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 UvragQ8K245 698 aa23.54■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scara5Q8K299 491 aa23.54■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa23.54■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xpo7Q9EPK7 1087 aa23.54■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf518bB2RRE4 1077 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam71aB7XG49 585 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam184aE9PW83 1143 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm2897K7N6T7 172 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 UrosP51163 265 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Htr4P97288 388 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brms1lQ3U1T3 323 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubn1Q4G0F8 1135 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rtl3Q6P1Y1 553 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efr3bQ6ZQ18 817 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MtrrQ8C1A3 696 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo21Q8VDH1 627 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Masp2Q91WP0 685 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hddc3Q9D114 179 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chmp2aQ9DB34 222 aa23.53■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm13283A0A087WPG5 182 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dmrta2A2A9A2 531 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C87414E9PWI7 475 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm597E9Q8J5 896 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxa9P09631 271 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Naf1Q3UMQ8 489 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SpdyaQ5IBH7 310 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttf2Q5NC05 1138 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Txndc8Q69AB2 127 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sec23ipQ6NZC7 998 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf423Q80TS5 1292 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Necab1Q8BG18 352 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubr7Q8BU04 425 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IntS13Q8QZV7 732 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Strn3Q9ERG2 796 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hmgn5Q9JL35 406 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ror1Q9Z139 937 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nfs1Q9Z1J3 459 aa23.52■■□□□ 1.36
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam43bA2AM80 330 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc23lA6H6E9 458 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm7275E9Q1B3 247 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm2888K7N746 267 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bub1O08901 1058 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RdxP26043 583 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adh5P28474 374 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tpm1P58771 284 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tespa1Q3U132 458 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Erich4Q3UNU4 136 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stard3Q61542 446 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tha1Q6XPS7 400 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mvb12aQ78HU3 271 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C5ar2Q8BW93 344 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Appl1Q8K3H0 707 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cpa5Q8R4H4 436 aa23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cisd3B1AR13 137 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AlpiF8VPQ6 554 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r86L7N213 316 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptpn9O35239 593 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cavin1O54724 392 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lbx1P52955 282 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AdkP55264 361 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rps24P62849 133 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taf3Q5HZG4 932 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Foxj1Q61660 421 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp3a13Q64464 503 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q66JV7 365 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr855Q7TRF8 312 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pnma3Q8JZW8 466 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prpf39Q8K2Z2 665 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tspan33Q8R3S2 283 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q9CQC3 228 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klhl40Q9D783 621 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CtsrQ9JIA9 334 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prmt1Q9JIF0 371 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myo10F8VQB6 2062 aa23.5■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plce1Q8K4S1 2282 aa23.49■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abhd12bG3UZN6 359 aa23.49■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gdi1P50396 447 aa23.49■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Polr3bP59470 1133 aa23.49■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gjb6P70689 261 aa23.49■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phactr1Q2M3X8 580 aa23.49■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Itpripl2Q3UV16 535 aa23.49■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tubal3Q3UX10 446 aa23.49■■□□□ 1.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PighQ5M9N4 188 aa23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms