RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 FBXO32Q969P5 355 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 HPDLQ96IR7 371 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CEP63Q96MT8 703 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 NME7Q9Y5B8 376 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 KCNK3O14649 394 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP1A3P13637 1013 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 STARD3Q14849 445 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTI2Q6NXR4 508 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMC6Q7Z403 805 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 NUP93Q8N1F7 819 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 AK5Q9Y6K8 562 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CETN3O15182 167 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CISD3P0C7P0 127 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 JUPP14923 745 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 GARTP22102 1010 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 OXTRP30559 389 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 DGKGP49619 791 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM14Q14142 442 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKRD40Q6AI12 368 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 OVCA2Q8WZ82 227 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 IQCDQ96DY2 449 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 ELOVL4Q9GZR5 314 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.551e-7■■■□□ 15.2
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYO18BQ8IUG5 2567 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1B0GTH6 734 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CAPN8A6NHC0 703 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLDN5O00501 218 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDXKO00764 312 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLIC2O15247 247 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TGFB1I1O43294 461 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 GREM1O60565 184 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMPRSS6Q8IU80 811 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CBWD2Q8IUF1 395 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNX19Q92543 992 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 BAP1Q92560 729 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 SIPA1Q96FS4 1042 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 MMS19Q96T76 1030 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 NUP58Q9BVL2 599 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 NACA2Q9H009 215 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSD3B7Q9H2F3 369 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLMPQ9H6B4 373 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 MARK1Q9P0L2 795 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 WDR35Q9P2L0 1181 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPRJQ12913 1337 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATMQ13315 3056 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 HECTD1Q9ULT8 2610 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRRC10BA6NIK2 292 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 H0Y8X5 98 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARHGAP6O43182 974 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 PCDHGA12O60330 932 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGLV3-19P01714 112 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 TUBP50607 506 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCT8P50990 548 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CYP2J2P51589 502 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL9RQ01113 521 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 LAYNQ6UX15 382 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 HTR3DQ70Z44 454 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM124AQ86V42 546 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 CACUL1Q86Y37 369 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 VSTM4Q8IW00 320 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 BHMTQ93088 406 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNX25Q9H3E2 840 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms