RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590096.1

ATG4D-212, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 1,282 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-212ENST00000590096 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ANKRD62A6NC57 917 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ACSL4O60488 711 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 F9P00740 461 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ABCB4P21439 1286 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 SDC4P31431 198 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 OPRD1P41143 372 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 GAB4Q2WGN9 574 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 FAM217AQ8IXS0 508 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 EMC1Q8N766 993 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 BHMTQ93088 406 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TRIM11Q96F44 468 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DEF6Q9H4E7 631 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 GJB6O95452 261 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TYRP14679 529 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PDGFRAP16234 1089 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DRD1P21728 446 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 RRM1P23921 792 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 MAGEA9P43362 315 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DEUP1Q05D60 604 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 MTA1Q13330 715 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PPP2R5DQ14738 602 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 WDR59Q6PJI9 974 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 NAT16Q8N8M0 369 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DDI1Q8WTU0 396 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 NT5C3BQ969T7 300 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TBCBQ99426 244 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 MYBL1P10243 752 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 SLC6A11P48066 632 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 MPPE1Q53F39 396 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TRNP1Q6NT89 227 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 C12orf40Q86WS4 652 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 CLDN23Q96B33 292 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF653Q96CK0 615 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PNKPQ96T60 521 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ISCUQ9H1K1 167 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PIGVQ9NUD9 493 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PARVAQ9NVD7 372 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PLK2Q9NYY3 685 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DEC1Q9P2X7 70 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 CACNG3O60359 315 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TSPAN3O60637 253 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 APODP05090 189 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 CHRNB1P11230 501 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 GPD1P21695 349 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ATP11AP98196 1134 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 CCINQ13939 588 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 MCEEQ96PE7 176 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 WDCPQ9H6R7 721 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 A0A087X0T9 212 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TULP3O75386 442 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 EGFP01133 1207 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms