RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CA9Q16790 459 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNDC8Q6A555 127 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DAAM2Q86T65 1068 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM131BQ86XD5 332 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MIB1Q86YT6 1006 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR65Q8IYL9 337 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC185Q8N715 623 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF592Q92610 1267 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMG2Q969U7 264 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM11Q96F44 468 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCD1Q96NT3 240 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NPY6RQ99463 290 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF38Q9H0F5 515 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZWILCHQ9H900 591 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PIDD1Q9HB75 910 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GKN1Q9NS71 199 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PARVAQ9NVD7 372 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IL37Q9NZH6 218 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 EHD2Q9NZN4 543 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC1BQ9P126 229 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAI1Q9UI46 699 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 INTUQ9ULD6 942 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SCML2Q9UQR0 700 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ALG6Q9Y672 507 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PPC1 479 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC12A8A0AV02 714 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM92AA1XBS5 289 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT86O43790 486 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HSF2BPO75031 334 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SRGAP2O75044 1071 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LRCH4O75427 683 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MTA2O94776 668 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PROSCO94903 275 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOP08100 348 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MIPP30301 263 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SDC4P31431 198 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCR5P32302 372 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MATKP42679 507 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IRAK1P51617 712 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNQ1P51787 676 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HDAC4P56524 1084 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZXDBP98169 803 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DEUP1Q05D60 604 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM15Q13444 863 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR158Q5T848 1215 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB123Q8N688 67 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 EFHBQ8N7U6 833 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NETO2Q8NC67 525 aa6.28□□□□□ -1.4
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