RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	BFSP1	Q12934	665 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	STRN3	Q13033	797 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DDR2	Q16832	855 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PIGK	Q92643	395 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HMX2	A2RU54	273 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093		K7ENM7	598 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SGK1	O00141	431 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CYB561D2	O14569	222 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	OGT	O15294	1046 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DYRK3	O43781	588 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	LRIG2	O94898	1065 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HTR3B	O95264	441 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FGF19	O95750	216 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PIGR	P01833	764 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP17A1	P05093	508 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CKM	P06732	381 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FST	P19883	344 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP2F1	P24903	491 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	NTF4	P34130	210 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	P2RY2	P41231	377 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC6A11	P48066	632 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	IFNAR2	P48551	515 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ACOT2	P49753	483 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TAF6	P49848	677 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	LIG4	P49917	911 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CLC	Q05315	142 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	KDSR	Q06136	332 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM29	Q14134	588 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CRY1	Q16526	586 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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