RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564584.1

CTU2-205, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 896 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-205ENST00000564584 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 GABRB2P47870 512 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 LIMK1P53667 647 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 USP46P62068 366 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TAF10Q12962 218 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CCDC6Q16204 474 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SLC18A3Q16572 532 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 IL31Q6EBC2 164 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 HHIPQ96QV1 700 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TMEM51Q9NW97 253 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 E5RJQ4 531 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 NFATC1O95644 943 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 APBB3O95704 486 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 MYBL1P10243 752 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 RALAP11233 206 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TUBP50607 506 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 DMC1Q14565 340 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PLK5Q496M5 336 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 BEND5Q7L4P6 421 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ZNF276Q8N554 614 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ACDQ96AP0 544 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CPXM1Q96SM3 734 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 EBF1Q9UH73 591 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 LEFTY2O00292 366 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 RHOBTB1O94844 696 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 DAOAP59103 153 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ZXDBP98169 803 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SLC6A3Q01959 620 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 RNF38Q9H0F5 515 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ISCUQ9H1K1 167 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 NAGPAQ9UK23 515 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 MYH10P35580 1976 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 A0A087X0T9 212 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 TM4SF5O14894 197 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 DCLK1O15075 740 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 HSF2BPO75031 334 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 ABL1P00519 1130 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 LTFP02788 710 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 FAM228BP0C875 321 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MPLP40238 635 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 OPRD1P41143 372 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 SLC7A9P82251 487 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 SPA17Q15506 151 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 ELF2Q15723 593 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 HECTD3Q5T447 861 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MON1BQ7L1V2 547 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 ARCQ7LC44 396 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.58□□□□□ -0.08
CTU2-205ENST00000564584 CHP1Q99653 195 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms