RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 DRD1P21728 446 aa19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 CCR1P32246 355 aa19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 NME3Q13232 169 aa19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 MTA1Q13330 715 aa19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 CCINQ13939 588 aa19.61■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF34Q969K3 372 aa19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 NT5C3BQ969T7 300 aa19.61■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 BTN2A3PQ96KV6 586 aa19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP19.61■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 F9P00740 461 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 CHRNB1P11230 501 aa19.6■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 SDC4P31431 198 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 GALK1P51570 392 aa19.6■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP2R5DQ14738 602 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 TRNP1Q6NT89 227 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 C12orf40Q86WS4 652 aa19.6■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 BHMTQ93088 406 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 CFAP57Q96MR6 1250 aa19.6■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa19.6■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 SIGLEC16A6NMB1 481 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 BRMS1LQ5PSV4 323 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR59Q6PJI9 974 aa19.59■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 DDI1Q8WTU0 396 aa19.59■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 PIGVQ9NUD9 493 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
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RABGGTA-208ENST00000558954 A0A087X0T9 212 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
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RABGGTA-208ENST00000558954 FAM228BP0C875 321 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
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RABGGTA-208ENST00000558954 DCUN1D2Q6PH85 259 aa19.58■□□□□ 0.72
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RABGGTA-208ENST00000558954 JOSD2Q8TAC2 188 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 RXFP2Q8WXD0 754 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF653Q96CK0 615 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 MCEEQ96PE7 176 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 PRRX2Q99811 253 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAM33Q9BZ11 813 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 ISCUQ9H1K1 167 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 DEF6Q9H4E7 631 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF4Q9NR80 690 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
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