RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ISM2Q6H9L7 571 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GPBP1Q86WP2 473 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CCDC65Q8IXS2 484 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 C4orf19Q8IY42 314 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 SPATA20Q8TB22 786 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 USP6NLQ92738 828 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GLG1Q92896 1179 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 SPATA33Q96N06 139 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 LXNQ9BS40 222 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TIPINQ9BVW5 301 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TRIM9Q9C026 710 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF302Q9NR11 478 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 EXOC1Q9NV70 894 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 PANK4Q9NVE7 773 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ING3Q9NXR8 418 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 KCND2Q9NZV8 630 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GJD2Q9UKL4 321 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CEP83Q9Y592 693 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 MYH4Q9Y623 1939 aa4.5□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 A0A087WWV3 80 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 MYMKA6NI61 221 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 SMTNL1A8MU46 457 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 MASP2O00187 686 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 PSMA7O14818 248 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ARIH2O95376 493 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GAAP10253 952 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GAP43P17677 238 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CYP11B2P19099 503 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CASP1P29466 404 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CNGA1P29973 690 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CYP2C19P33261 490 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 FLT3LGP49771 235 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 RARRES1P49788 294 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 SLC12A3P55017 1021 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 PRMT2P55345 433 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 PSMC6P62333 389 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 MXRA7P84157 204 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TNFAIP2Q03169 654 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 MORC3Q14149 939 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF460Q14592 562 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 XKR9Q5GH70 373 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 UNC13DQ70J99 1090 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 KCNK18Q7Z418 384 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ERO1AQ96HE7 468 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 FAM167AQ96KS9 214 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 CEP170P1Q96L14 293 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 NDC1Q9BTX1 674 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 TSPYL1Q9H0U9 437 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 GRPEL1Q9HAV7 217 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 SPC25Q9HBM1 224 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 OXSMQ9NWU1 459 aa4.49□□□□□ -1.69
FOXN3-210ENST00000555658 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms