RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553301.1

AL845552.2-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AL845552.2, Length 553 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL845552.2-201ENST00000553301 ZNF18P17022 549 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 GBP1P32455 592 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 CDK17Q00537 523 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ELF2Q15723 593 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ANO7Q6IWH7 933 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 CHPFQ8IZ52 775 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SPACA7Q96KW9 195 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 RRN3Q9NYV6 651 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.8■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 TRIM24O15164 1050 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ADAM23O75077 832 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 RHOBTB1O94844 696 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 HOXB2P14652 356 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SCNN1AP37088 669 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 EMC10Q5UCC4 262 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 TAC4Q86UU9 113 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SLC39A13Q96H72 371 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SPAG5Q96R06 1193 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 GABRG3Q99928 467 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 GANQ9H2C0 597 aa21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 PRRT4C9JH25 899 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 IGLV3-25P01717 112 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SLC6A3Q01959 620 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 UBXN1Q04323 297 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 NCAPHQ15003 741 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 TMEM92Q6UXU6 159 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 NEK11Q8NG66 645 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.78■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ZNF292O60281 2723 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SDHBP21912 280 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SOX5P35711 763 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 STAT1P42224 750 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 LMNB2Q03252 620 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ARID5AQ03989 594 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 STARD3Q14849 445 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SYCP1Q15431 976 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 DCAF6Q58WW2 860 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.77■■□□□ 1.08
AL845552.2-201ENST00000553301 DAB1O75553 588 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 CCR1P32246 355 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 GABRB2P47870 512 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 JAM2P57087 298 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 LPAL2Q16609 132 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 RNF43Q68DV7 783 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 ERICH1Q86X53 443 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 DEFB106AQ8N104 65 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 AHI1Q8N157 1196 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 C18orf8Q96DM3 657 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.76■■□□□ 1.07
AL845552.2-201ENST00000553301 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms