RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PMF1Q6P1K2 205 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 POTEHQ6S545 545 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM110Q86TL2 294 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC30AQ86WT1 665 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CHPFQ8IZ52 775 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 NAT16Q8N8M0 369 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 LMO3Q8TAP4 145 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 USP33Q8TEY7 942 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 GAB3Q8WWW8 586 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SHC3Q92529 594 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ELMO3Q96BJ8 720 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CHFRQ96EP1 664 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ANP32EQ9BTT0 268 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 DONSONQ9NYP3 566 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SUN2Q9UH99 717 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC12Q9UKB3 198 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 USP18Q9UMW8 372 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 NME7Q9Y5B8 376 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPRDP23468 1912 aa5.84□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 E7ENQ6 273 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 F5H5T6 163 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFS2O75306 463 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ASLP04424 464 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXB2P14652 356 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 UCHL3P15374 230 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC9A1P19634 815 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 OXTRP30559 389 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 RDXP35241 583 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXD12P35452 270 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 OPRD1P41143 372 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 STAT1P42224 750 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NSFP46459 744 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FNTBP49356 437 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 RGS7P49802 495 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 UBXN1Q04323 297 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCLQ13371 301 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC12A1Q13621 1099 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH18Q13634 790 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PKDCCQ504Y2 493 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DCAF6Q58WW2 860 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6B2Q6IFH4 312 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC31Q6UY01 552 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZNB5 142 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZS52 159 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SCD5Q86SK9 330 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS36Q86VN1 386 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ERICH1Q86X53 443 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM25Q86YD3 366 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MFN1Q8IWA4 741 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM71AQ8IYT1 594 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 AHI1Q8N157 1196 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 UBR7Q8N806 425 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP76Q8TAP6 659 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TFAP2BQ92481 460 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 EDEM1Q92611 657 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXJ1Q92949 421 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 C18orf8Q96DM3 657 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CIPCQ9C0C6 399 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NMUR1Q9HB89 426 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SUSD2Q9UGT4 822 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms