RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	EID2B	Q96D98	161 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	UTRN	P46939	3433 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	INSR	P06213	1382 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	AGR2	O95994	175 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PYGL	P06737	847 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CSF1R	P07333	972 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ANXA6	P08133	673 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	INSRR	P14616	1297 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RBL1	P28749	1068 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SLC5A2	P31639	672 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SCAP	Q12770	1279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CSHL1	Q14406	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PCDH17	O14917	1159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	NTSR2	O95665	410 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PDHA1	P08559	390 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	AR	P10275	920 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CD19	P15391	556 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	KLRK1	P26718	216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	BMPR1A	P36894	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	GSTM5	P46439	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PRELP	P51888	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ITIH3	Q06033	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	EXTL1	Q92935	676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	TBATA	Q96M53	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-223	ENST00000536089	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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