RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	MCF2	P10911	925 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STAT5B	P51692	787 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	AQP5	P55064	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GBE1	Q04446	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ORC1	Q13415	861 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	OCEL1	Q9H607	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MCF2L	O15068	1137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STRN	O43815	780 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ATP9B	O43861	1147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RNF8	O76064	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	USP1	O94782	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	APBA3	O96018	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	OSBP	P22059	807 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PGM1	P36871	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NR2C2	P49116	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HMGCS2	P54868	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ASB7	Q9H672	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897		A0A1B0GVG6	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897		B2RBV5	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897		H3BRJ5	948 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ACOT8	O14734	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DCLK1	O15075	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FKBP6	O75344	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IFNB1	P01574	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PDHA1	P08559	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GNAT1	P11488	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MYL4	P12829	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC130	P13994	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STIL	Q15468	1287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GPR78	Q96P69	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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