RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 GRK2P25098 689 aa11.86□□□□□ -0.51
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PTPRK-217ENST00000524534 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.85□□□□□ -0.51
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PTPRK-217ENST00000524534 NAT14Q8WUY8 206 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.85□□□□□ -0.51
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PTPRK-217ENST00000524534 RSPH3Q86UC2 560 aa11.85□□□□□ -0.51
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PTPRK-217ENST00000524534 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 ATP2A3Q93084 1043 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.514e-7■■■■□ 23.4
PTPRK-217ENST00000524534 NDNQ99608 321 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 MGAMO43451 1857 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 SDC4P31431 198 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 MTTPP55157 894 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
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