RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513440.5

CLOCK-211, Transcript of clock circadian regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLOCK, Length 3,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCK-211ENST00000513440 MYL3P08590 195 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 ERVK-10P10266 1014 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 CCDC6Q16204 474 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PSAT1Q9Y617 370 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 HMX2A2RU54 273 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 GPR32O75388 356 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 MXRA7P84157 204 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 DPYSL2Q16555 572 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PPM1JQ5JR12 505 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 ZNF410Q86VK4 478 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 FBXO27Q8NI29 283 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 INPP5DQ92835 1189 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 NSL1Q96IY1 281 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 CAPN9O14815 690 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PDE1BQ01064 536 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 WSCD1Q658N2 575 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PID1Q7Z2X4 250 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 AGR3Q8TD06 166 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 TINF2Q9BSI4 451 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 KATNBL1Q9H079 304 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 BRCA2P51587 3418 aa14.5□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SNX16P57768 344 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PARP6Q2NL67 630 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 TTC39CQ8N584 583 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 P2RY11Q96G91 374 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 EBF4Q9BQW3 602 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 UBP1Q9NZI7 540 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 CPA4Q9UI42 421 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 MEI4A8MW99 385 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 TPP1O14773 563 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PDHA1P08559 390 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SAT1P21673 171 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 RNF169Q8NCN4 708 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 AZIN2Q96A70 460 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.095e-13■■■■□ 20.4
CLOCK-211ENST00000513440 SYBUQ9NX95 663 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 CCDC22O60826 627 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 KRT36O76013 467 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 TSHRP16473 764 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PRKCHP24723 683 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 TAF6P49848 677 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PGGT1BP53609 377 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 RSPH3Q86UC2 560 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 STKLD1Q8NE28 680 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 RNF139Q8WU17 664 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 ZNF358Q9NW07 568 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.49□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
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CLOCK-211ENST00000513440 B2RBV5 119 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 FAM72CH0Y354 149 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 SETSIPP0DME0 302 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 CHSY1Q86X52 802 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 FAM72BQ86X60 149 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 EDEM1Q92611 657 aa14.48□□□□□ -0.09
CLOCK-211ENST00000513440 RTP4Q96DX8 246 aa14.48□□□□□ -0.09
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