RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 ZNF410Q86VK4 478 aa17.23■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 RFWD2Q8NHY2 731 aa17.23■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 KCNK16Q96T55 309 aa17.23■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa17.23■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 LRCH1Q9Y2L9 728 aa17.23■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SNX10Q9Y5X0 201 aa17.23■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ALOX15BO15296 676 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SULT1E1P49888 294 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ATP11CQ8NB49 1132 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 TTC13Q8NBP0 860 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SLC35F5Q8WV83 523 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 EDEM1Q92611 657 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 WNT8BQ93098 351 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 TTC17Q96AE7 1141 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ARL8BQ9NVJ2 186 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 RABGEF1Q9UJ41 708 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 NRCAMQ92823 1304 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 TBX10O75333 385 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 F2P00734 622 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SERPINB4P48594 390 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 MAP2K5Q13163 448 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 NOMO1Q15155 1222 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 CES3Q6UWW8 571 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 MAP7D3Q8IWC1 876 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 MPP5Q8N3R9 675 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 FNIP1Q8TF40 1166 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 WDR60Q8WVS4 1066 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 AGAP3Q96P47 875 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ZIC5Q96T25 663 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SLC13A1Q9BZW2 595 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 PCMTD2Q9NV79 361 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 MORF4L1Q9UBU8 362 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ACTL7BQ9Y614 415 aa17.22■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ZCCHC18P0CG32 403 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SKIP12755 728 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 GMPRP36959 345 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 TRIM32Q13049 653 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 EPAS1Q99814 870 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 TTLL3Q9Y4R7 772 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 CYB561D2O14569 222 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 METTL18O95568 372 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 POMCP01189 267 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 FAAP100Q0VG06 881 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 AP1B1Q10567 949 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 PPP2R5DQ14738 602 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 CMPK2Q5EBM0 449 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SYPL2Q5VXT5 272 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 KCNT2Q6UVM3 1135 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
PFKL-211ENST00000498841 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP17.21■□□□□ 0.351e-6■■□□□ 12.3
PFKL-211ENST00000498841 C2orf71A6NGG8 1288 aa17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 USP12O75317 370 aa17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 GABRB2P47870 512 aa17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 USP4Q13107 963 aa17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 TFDP2Q14188 446 aa17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 MCUR1Q96AQ8 359 aa17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 WASF2Q9Y6W5 498 aa17.21■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 RRN3P2A6NIE6 340 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 KCNK1O00180 336 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 TAF6P49848 677 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 PTK7Q13308 1070 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 CTC1Q2NKJ3 1217 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 IFT43Q96FT9 208 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 GORASP1Q9BQQ3 440 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 NUDT5Q9UKK9 219 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 COL1A2P08123 1366 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 F8W810 466 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 GYG2O15488 501 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 MYCP01106 439 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 LMNAP02545 664 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 LILRA4P59901 499 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 SLC5A9Q2M3M2 681 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 FYB2Q5VWT5 728 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 KBTBD2Q8IY47 623 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 TCP10LQ8TDR4 215 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 TTC25Q96NG3 672 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 LRRC4Q9HBW1 653 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 KRT82Q9NSB4 513 aa17.2■□□□□ 0.34
PFKL-211ENST00000498841 KANSL3Q9P2N6 904 aa17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms