RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 LSM8O95777 96 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CHRNB2P17787 502 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC11A2P49281 568 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC6A3Q01959 620 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 NNTQ13423 1086 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 MPPE1Q53F39 396 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ERICH1Q86X53 443 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF677Q86XU0 584 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CPA5Q8WXQ8 436 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 AZIN2Q96A70 460 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 EPC1Q9H2F5 836 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 HCN2Q9UL51 889 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CLEC4EQ9ULY5 219 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 STARD13Q9Y3M8 1113 aa17.56■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ADAM23O75077 832 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 APBB3O95704 486 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 IGLV3-25P01717 112 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC6A4P31645 630 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 GABRB2P47870 512 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SGSHP51688 502 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 NOMO3P69849 1222 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CDK17Q00537 523 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CDR2Q01850 454 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ARID5AQ03989 594 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CRY1Q16526 586 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 FILIP1LQ4L180 1135 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 NAA35Q5VZE5 725 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 RFWD3Q6PCD5 774 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM92Q6UXU6 159 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 C18orf8Q96DM3 657 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM204AQ9H8W3 233 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa17.55■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 IRAK2O43187 625 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CNR2P34972 360 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 DGKEP52429 567 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF445P59923 1031 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 FMO1Q01740 532 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 GEN1Q17RS7 908 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 C2CD6Q53TS8 623 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 EOGTQ5NDL2 527 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 PIK3R6Q5UE93 754 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 NADSYN1Q6IA69 706 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC26A9Q7LBE3 791 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 LUZP1Q86V48 1076 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 XYLT1Q86Y38 959 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC2A11Q9BYW1 496 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 DDIT4Q9NX09 232 aa17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP54Q96N23 3096 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1B0GTH6 734 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 AXIN1O15169 862 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 DAB1O75553 588 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SERPINC1P01008 464 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 APOEP02649 317 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 NTSR1P30989 418 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 WASP42768 502 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 LPAL2Q16609 132 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 PRR23BQ6ZRT6 265 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 MSANTD4Q8NCY6 345 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ACOX2Q99424 681 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 COX16Q9P0S2 106 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 EBF1Q9UH73 591 aa17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 GOLGA8SH3BPF8 625 aa17.52■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 TBL1XO60907 577 aa17.52■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 GBP1P32455 592 aa17.52■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 NOS2P35228 1153 aa17.52■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ANO7Q6IWH7 933 aa17.52■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa17.52■□□□□ 0.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CHPFQ8IZ52 775 aa17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms