RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496526.5

TTLL3-232, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 5,282 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-232ENST00000496526 USP41Q3LFD5 358 aa11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 IL17RAQ96F46 866 aa11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 SH3GL1Q99961 368 aa11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 ADNPQ9H2P0 1102 aa11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.28□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 BMP10O95393 424 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 THRAP10827 490 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 NPR3P17342 541 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 PGAM1P18669 254 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 CDH8P55286 799 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 PTENP60484 403 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 BTKQ06187 659 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 JADE3Q92613 823 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 THTPAQ9BU02 230 aa11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TTLL3-232ENST00000496526 IFNA14P01570 189 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PRKAA2P54646 552 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 NAB1Q13506 487 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC130P13994 396 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CTNNB1P35222 781 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CHKAP35790 457 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 SKP1P63208 163 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 GRIK3Q13003 919 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CDC16Q13042 620 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 GRTP1Q5TC63 336 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 RFX8Q6ZV50 586 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 KRT78Q8N1N4 520 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 IGFLR1Q9H665 355 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 ACTR8Q9H981 624 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 TM9SF1O15321 606 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PARNO95453 639 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 USP17L7P0C7H9 530 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CRABP2P29373 138 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 HALP42357 657 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PRKAA1Q13131 559 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 GRIK5Q16478 980 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 WSCD1Q658N2 575 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 MTSS1LQ765P7 747 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PPTC7Q8NI37 304 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 MPP6Q9NZW5 540 aa11.27□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 E5RJQ4 531 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 RAD51BO15315 384 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 GP5P40197 560 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 USP45Q70EL2 814 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 STK40Q8N2I9 435 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 MTA2O94776 668 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 MMP13P45452 471 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 E2F4Q16254 413 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 DUSP28Q4G0W2 176 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 KAT2BQ92831 832 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 MAGEB18Q96M61 343 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 FAM50BQ9Y247 325 aa11.26□□□□□ -0.61
TTLL3-232ENST00000496526 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms