RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 GSK3AP49840 483 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC42EP1Q00587 391 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC20Q12834 499 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SERINC3Q13530 473 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM14Q14142 442 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DOC2AQ14183 400 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GRM4Q14833 912 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 SERINC5Q86VE9 423 aa4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 RFXAPO00287 272 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR182O15218 404 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TP73O15350 636 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PEX1O43933 1283 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.654e-37■■■□□ 18.2
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RABGGTB-213ENST00000496055 PEX3P56589 373 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CARD18P57730 90 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 STKLD1Q8NE28 680 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 FAM192AQ9GZU8 254 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 SIPA1L1O43166 1804 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SMCO2A6NFE2 343 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BNC9 293 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 AP5Z1O43299 807 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAPPC3O43617 180 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ASMTLO95671 621 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 BAG2O95816 211 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CHEK2O96017 543 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 HOXD13P35453 343 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 NOVP48745 357 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 DNM2P50570 870 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 ERV3-1Q14264 604 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PGM5Q15124 567 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 EPC2Q52LR7 807 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP55Q53EZ4 464 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SGO2Q562F6 1265 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FSCBQ5H9T9 825 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.72□□□□□ -1.65
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