RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, human

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLXNA3-208	ENST00000495040	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	IGLV3-27	P01718	113 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	PTGER3	P43115	390 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	ENPP2	Q13822	863 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	STK32A	Q8WU08	396 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	LAMA1	P25391	3075 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	LNP1	A1A4G5	178 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	TIMM44	O43615	452 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	NCAM1	P13591	858 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC9A1	P19634	815 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	RING1	Q06587	406 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SYT12	Q8IV01	421 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	CIPC	Q9C0C6	399 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	THAP12	O43422	761 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	GNA15	P30679	374 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	IL12RB1	P42701	662 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC11A2	P49281	568 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	TBX4	P57082	545 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	GJB7	Q6PEY0	223 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	AZIN2	Q96A70	460 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	PATE3	B3GLJ2	98 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADRB1	P08588	477 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARID5A	Q03989	594 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF234	Q14588	700 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SERPINB11	Q96P15	392 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	IRAK2	O43187	625 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	FYN	P06241	537 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	HOXD12	P35452	270 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	USP8	P40818	1118 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	NNT	Q13423	1086 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	FUT11	Q495W5	492 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	MPP7	Q5T2T1	576 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	TMEM215	Q68D42	235 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	BEND5	Q7L4P6	421 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	THAP9	Q9H5L6	903 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	CKAP5	Q14008	2032 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PLXNA3-208	ENST00000495040	C4orf47	A7E2U8	309 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	ACSL4	O60488	711 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	PON1	P27169	355 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	HLA-F	P30511	346 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	IRX4	P78413	519 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	LMAN2	Q12907	356 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	TMEM110	Q86TL2	294 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	ACP6	Q9NPH0	428 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	DACH1	Q9UI36	760 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	BECN2	A8MW95	431 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	CAPN9	O14815	690 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	KCNA4	P22459	653 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	ITPKA	P23677	461 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF33A	Q06730	810 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAN2A1	Q16706	1144 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PLXNA3-208	ENST00000495040	DEFB119	Q8N690	84 aa		27.69	■■■□□ 2.02

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