RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 HYAL1Q12794 435 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CNGA2Q16280 664 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TRNP1Q6NT89 227 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 BBOF1Q8ND07 529 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SERPINB12Q96P63 405 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PEBP4Q96S96 227 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TRIM4Q9C037 500 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 A0A0U1RQF3 1178 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RBP3P10745 1247 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 VDRP11473 427 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NEFHP12036 1026 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MTHFRP42898 656 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 VSTM1Q6UX27 236 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CROCCP2Q86T23 111 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 LEMD2Q8NC56 503 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CCDC77Q9BR77 488 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RASA4BC9J798 803 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RASA4O43374 803 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PYGBP11216 843 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CYP2C9P11712 490 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CDC25CP30307 473 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 BBS9Q3SYG4 887 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PMF1Q6P1K2 205 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KRT15P19012 456 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ADORA2BP29275 332 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SSTR1P30872 391 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ATICP31939 592 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 COPS2P61201 443 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 BEX3Q00994 111 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 LRRC43Q8N309 656 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MYLIPQ8WY64 445 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 COMMD8Q9NX08 183 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 H7C0C1 242 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PRPSAP2O60256 369 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CDH16O75309 829 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RECQL4O94761 1208 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 GPD1P21695 349 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ATP5OP48047 213 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CCDC142Q17RM4 750 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MSS51Q4VC12 460 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAXCQ5TGI0 409 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 LILRA6Q6PI73 481 aa7.27□□□□□ -1.25
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