RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 MATN1P21941 496 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADSSP30520 456 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXC9P31274 260 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPX6P59796 221 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 BST1Q10588 318 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TROAPQ12815 778 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 DSC3Q14574 896 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGSF11Q5DX21 431 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNK18Q7Z418 384 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM47BQ8NA70 645 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SP140LQ9H930 580 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARMT1Q9H993 441 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNRQ92752 1358 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0G2JMP0 313 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LPXNO60711 386 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT34O76011 436 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MCF2P10911 925 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAMPTP43490 491 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLCNKBP51801 687 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNQ4P56696 695 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP4CP60510 307 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 STX1BP61266 288 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPLD1P80108 840 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 POU6F1Q14863 301 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFHC2Q5JST6 749 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CADM2Q8N3J6 435 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXL6Q8N531 539 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LEMD2Q8NC56 503 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SERAC1Q96JX3 654 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSF3RQ99062 836 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEPT3Q9UH03 358 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 RTL9Q8NET4 1388 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0X1KG70 313 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF839A8K0R7 811 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLDN25C9JDP6 229 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPAG6O75602 509 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCL10O95999 233 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNAO1P09471 354 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCNA2P20248 432 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPN5P54829 565 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNK2Q07912 1038 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 COASYQ13057 564 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 IKBKEQ14164 716 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNA13Q14344 377 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBE3CQ15386 1083 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 APPL2Q8NEU8 664 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CITED4Q96RK1 184 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 YME1L1Q96TA2 773 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 STMN3Q9NZ72 180 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 STK25O00506 426 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGFR3P22607 806 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRIA1P42261 906 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPN9P43378 593 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRAMEP78395 509 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF846Q147U1 533 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRNA2Q15822 529 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms